Bioinformatik (Einfuehrung Bioinf)5 ECTS
(englische Bezeichnung: Bioinformatics)
(Prüfungsordnungsmodul: Bioinformatik)

Lehrveranstaltungen:

• • Grundlagen der Bioinformatik
    (Vorlesung, 2 SWS, Heinrich Sticht, Mi, 10:15 - 12:00, H Biochemie, Fahrstr. 17; ab 18.4.2018)
  • Übung Bioinformatik
    (Übung, 3 SWS, Heinrich Sticht, Zeit n.V., In. f. Biochemie Med. Fak.; CIP-Pool)

Inhalt:

• Quellen für Sequenzdaten und Sequenzdatenbanken

• Proteinähnlichkeit und Proteinevolution

• Kriterien zur Bewertung der Proteinähnlichkeit

• Methoden zum paarweisen Sequenzvergleich

• Algorithmen für schnelle Datenbanksuchen

• Sekundäre Datenbanken

• Multiples Sequenzalignment

• Grundlagen von Proteinstrukturen

• Vergleich von Proteinstrukturen

• Sekundärstrukturvorhersage

• Vorhersage von Proteinstrukturen
  

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• kennen und nachvollziehen elementare Fragestellungen und wesentliche Grundlagen der Bioinformatik

• kennen die Standardwerkzeuge zum Durchführen von Sequenzvergleichen, zur Suche in Sequenzdatenbanken und zur Sekundärstrukturvorhersage

• wählen geeignete Werkzeuge und Parameter zur Bewertung der entsprechenden Ergebnisse und zum Erkennen möglicher Fehler aus

• kennen und bewerten elementare bioinformatische Verfahren zur Strukturvorhersage und Strukturanalyse

• wenden die mathematischen und statistischen Grundlagen der Verfahren an

• können geeignete bioinformatische Verfahren zur Bearbeitung molekularbiologischer Fragen selbständig auswählen
  

Literatur:

Literatur auf der (passwortgeschützten) Webseite http://www.biochem.uni-erlangen.de/studium/index.php unter „Downloads Bioinformatik“ verfügbar

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

1. Life Science Engineering (Master of Science)
   (Po-Vers. 2015w | TechFak | Life Science Engineering (Master of Science) | Ergänzungsmodule | Bioinformatik)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Bioinformatik (Prüfungsnummer: 20501)

(englischer Titel: Bioinformatics)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet, 5 ECTS

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

Erstablegung: SS 2018, 1. Wdh.: WS 2018/2019

1. Prüfer:

Heinrich Sticht

Termin: 11.07.2018, 10:15 Uhr
Termin: 06.02.2019, 10:15 Uhr, Ort: Hörsaal Physiologie, Waldstr. 6
Termin: 05.02.2020, 10:15 Uhr, Ort: Raum 01.030, Inst. für Biochemie, Fahrstr. 17