Molecular Modelling (MSV-6L)5 ECTS
(englische Bezeichnung: Molecular modelling)
(Prüfungsordnungsmodul: Molecular Modelling)

Lehrveranstaltungen:

• • Molecular Modelling (V/UE) (WS 2017/2018)
    (Vorlesung mit Übung, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.206; Mo, 12:00 - 18:00, CCC 2.203, CCC 2.202a; Do, 10:30 - 17:00, CCC 2.206, CCC 2.203, CCC 2.202a; vom 6.11.2017 bis zum 16.12.2017)
  • Molecular Modeling PRA (SS 2018)
    (Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; vom 23.4.2018 bis zum 4.5.2018; Anmeldung über StudON; für die genaue Zeiten, siehe Stundenplan)

Empfohlene Voraussetzungen:

Es wird empfohlen, folgende Module zu absolvieren, bevor dieses Modul belegt wird:

Biochemie und Molekularbiologie I und II (WS 2016/2017)

Inhalt:

MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modelling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden

• können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen

• sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen

• sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.

Bemerkung:

Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung Lifescience)

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

1. Molecular Science (Bachelor of Science)
   (Po-Vers. 2013 | NatFak | Molecular Science (Bachelor of Science) | Vertiefungsrichtung Nano Science / Life Science | Vertiefungsrichtung Life Science | Molecular Modelling)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Molecular Modelling (Prüfungsnummer: 30611)

(englischer Titel: Molecular Modelling)

Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

weitere Erläuterungen:
PFP:
Molecular Modelling: W90 (PL)
Seminar Molecular Modelling: EX (PL)
Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL, AP)
Berechnung der Modulnote: W90 (PL) 50%, EX (PL) 25%, LAB (PL, AP) 25%
Achtung:
Erstablegung der Klausur erfolgt im Wintersemester, die 1.Wiederholungsmöglichkeit dann im Sommersemester; Notenverbuchung von Klausurnote und Praktikumsleistungen erfolgt erst im Sommersemester!

Prüfungssprache: Deutsch

Erstablegung: WS 2017/2018, 1. Wdh.: SS 2018

1. Prüfer:

Dirk Zahn

Termin: 16.02.2018, 11:00 Uhr
Termin: 11.07.2018, 16:30 Uhr, Ort: H 2 NatFak
Termin: 15.02.2019, 08:30 Uhr