Molecular Modelling (MSV-6L)5 ECTS
(englische Bezeichnung: Molecular modelling)
(Prüfungsordnungsmodul: Molecular Modelling)

Lehrveranstaltungen:

• • Molecular Modelling (V/UE) (WS 2019/2020)
    (Vorlesung mit Übung, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.206; Mo, 12:00 - 18:00, CCC 2.203, CCC 2.202a; Do, 10:30 - 17:00, CCC 2.206, CCC 2.203, CCC 2.202a; vom 25.11.2019 bis zum 14.12.2019)
  • Molecular Modeling PRA (SS 2020)
    (Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Anmeldung über StudON; für die genaue Zeiten, siehe Stundenplan)

Empfohlene Voraussetzungen:

Es wird empfohlen, folgende Module zu absolvieren, bevor dieses Modul belegt wird:

Biochemie und Molekularbiologie I und II (WS 2018/2019)

Inhalt:

MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modelling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden

• können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen

• sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen

• sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.

Bemerkung:

Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung Lifescience)

Organisatorisches:

Achtung:
Erstablegung der Klausur erfolgt im Wintersemester, die 1.Wiederholungsmöglichkeit dann im Sommersemester;
Notenverbuchung von Klausurnote und Praktikumsleistungen erfolgt erst im Sommersemester!

Bitte beachten: Im SoSe 2020 finden die Lehrveranstaltungen voraussichtlich online statt, melden Sie sich dazu bitte auf StudOn an, um weitere Informationen zu bekommen: https://www.studon.fau.de/crs2554439_join.html

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

1. Molecular Science (Bachelor of Science)
   (Po-Vers. 2013 | NatFak | Molecular Science (Bachelor of Science) | Vertiefungsrichtung Nano Science / Life Science | Vertiefungsrichtung Life Science | Molecular Modelling)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Molecular Modelling (Prüfungsnummer: 30611)

(englischer Titel: Molecular Modelling)

Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

weitere Erläuterungen:
PFP:
Molecular Modelling: *W90 (PL)= Schriftliche Prüfung (90 Minuten) oder Alternativ-Prüfung, gemäß Corona-Satzung der FAU!
Seminar Molecular Modelling: EX (PL)
Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL)
Berechnung der Modulnote: W90 (PL)* 50%, EX (PL) 25%, LAB (PL) 25%

Prüfungssprache: Deutsch

Erstablegung: WS 2019/2020, 1. Wdh.: WS 2019/2020

1. Prüfer:

Dirk Zahn

Termin: 14.02.2020, 08:30 Uhr, Ort: H1
Termin: 19.02.2021, 08:30 Uhr, Ort: C1 und C2