Computational Biology (ILS-W1)15 ECTS
(englische Bezeichnung: Computational Biology)

Lehrveranstaltungen:

• • Übung ILS W1 Computational Biology
    (Übung, Vadym Aizinger et al., Di, 16:00 - 18:00, Praktikum 2 / 00.327-128)
  • Computational Biology (ILS 5. Semester)
    (Vorlesung, Rainer Böckmann, Di, 8:00 - 10:00, SR Biologie)
  • Literaturseminar Computational Biology
    (Seminar, 1 SWS, Rainer Böckmann, Do, 14:00 - 15:00, Raum n.V.; Raum Nr. 03.663-1 im Biologikum)

Inhalt:

Einführung in moderne Programmier-Sprachen und Simulations-Umgebungen:

• Programmierung in MATLAB (einschliesslich der Einbindung einfacher C++ Programme)

• Einführung in Diskretisierungs- und Lösungsverfahren für partielle Differentialgleichungen zur Beschreibung dynamischer Systeme

• Datenbankformate und Skript-Sprachen (PYTHON, PERL) in der Bioinformatik.

Simulation dynamischer Systeme am Beispiel aktueller biologischer Fragestellungen, z.B:

• Metabolische Flüsse

• Signaltransduktion und Transkriptions-regulatorische Netzwerke

• Zeitlich periodische Systeme

• Biologische Musterbildung

• Moleküldynamik

• Zellbewegung und morphogenetische Bewegungen

• Populationsgenetik und Evolutionsmodelle.
  

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• verfügen über vertiefte Kenntnisse wichtiger Programmier- und Simulationsumgebungen

• sind fähig aktuelle Simulationsmodelle in Computational Biology am Computer selbständig anzuwenden

• sind mit aktuellen Publikationen aus dem Bereich Computational Biology vertraut

• können die Inhalte aktueller Publikationen aus dem Lerngebiet diskutieren und hinterfragen

• verfügen über Kommunikationskompetenz.
  

Literatur:

Informationsmaterialien zur Vor- und Nachbereitung des Stoffes werden im Internet und als Kopien zur Verfügung gestellt.

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
Das Modul ist im Kontext der folgenden Studienfächer/Vertiefungsrichtungen verwendbar:

1. Informatik (Master of Science)
   (Po-Vers. 2010 | TechFak | Informatik (Master of Science) | Nebenfach | Nebenfach Biologie | Wahlpflichtbereich | Computational Biology)
2. Integrated Life Sciences: Biologie, Biomathematik, Biophysik (Bachelor of Science)
   (Po-Vers. 2009 | NatFak | Integrated Life Sciences: Biologie, Biomathematik, Biophysik (Bachelor of Science) | Bachelorprüfung | Integrierte Wahlpflichtmodule | Computational Biology)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Klausur Computational Biology (Teil 1) (Prüfungsnummer: 32702)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2018/2019, 1. Wdh.: SS 2019

1. Prüfer:

Rainer Böckmann

Termin: 13.09.2019, 14:00 Uhr
Termin: 13.02.2020, 10:00 Uhr, Ort: SR Biologie (U1.850)

Klausur Computational Biology II (Prüfungsnummer: 32703)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2018/2019, 1. Wdh.: SS 2019

1. Prüfer:

Vasily Zaburdaev

Termin: 18.02.2019, 10:00 Uhr, Ort: Erlangen, Cauerstr. 11, Praktikum 1 / 00.325-128