Orientierungsmodul Biochemie III: Einführung in die Sequenzanalyse (BCMA III)7.5 ECTS
(englische Bezeichnung: BCMA III: Introduction to sequence analysis)
(Prüfungsordnungsmodul: BCMA III: Introduction to Sequence Analysis)

Lehrveranstaltungen:

• • Orientierungsmodul Biochemie III: Einführung in die Sequenzanalyse
    (Übung, 8 SWS, Anwesenheitspflicht, Uwe Sonnewald et al., Zeit und Raum n.V.)

Inhalt:

• Einführung in Sequenzanalysen und Sequenzformate

• Genomstrukturen

• Analyse von Gensequenzen

• Genetische Marker (SNPs und INDELs)

• Next Generation Sequencing (NGS)

• Genomkartierung und Genomannotation

• Populationsgenetische Analysen

• Genetische Kartierung

• Erstellung analytischer Pipelines

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• kennen und sind in der Lage verschiedene Datenbanken und Sequenzanalyse-Software zu auf eine Fragestellung anzuwenden

• können Programme zum Vergleich von Sequenzen anwenden (BLAST)

• sind in der Lage verschiedene NGS-Methoden zu beschreiben sowie Vor- und Nachteile dieser Methoden zu erklären

• können genetische Marker mittels bioinformatischer Methoden identifizieren

• sind in der Lage NGS-Daten zu analysieren

• können Assoziationsanalysen durchführen (Interaktion von Phänotyp- und Genotyp-Daten)

• können analytische Pipelines erstellen, welche eine schrittweise Analyse von NGS-Daten erlauben

• sind zur Bearbeitung von einem eigenen Datensatz in einem hypothetischen Projekt befähigt

• sind in der Lage eine Präsentation sowie einen wissenschaftlichen Bericht zu erstellen, welche die Ergebnisse aus dem hypothetischen Projekt diskutieren und in Zusammenhang mit Ergebnissen aus verschiedenen wissenschaftlichen Publikationen setzen.
  

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

1. Zell- und Molekularbiologie (Master of Science)
   (Po-Vers. 2019w | NatFak | Zell- und Molekularbiologie (Master of Science) | Orientierungsmodule | Biologische Orientierungsmodule | BCMA III: Introduction to Sequence Analysis)

Studien-/Prüfungsleistungen:

BCMA III: Introduction to Sequence Analysis (Prüfungsnummer: 22802)

(englischer Titel: BCMA III: Introduction to sequence analysis)

Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet, 7.5 ECTS

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

weitere Erläuterungen:
SL: wissenschaftliche Präsentation (20 min) PL: mündliche Prüfung (30 min) PL: schriftlicher Bericht (ca. 10 – 20 Seiten)
Berechnung der Note 30% mündliche Prüfung, 70% schriftlicher Bericht

Erstablegung: SS 2022

1. Prüfer:

Uwe Sonnewald