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Retrospektive Mikroskopie

Die Herstellung histologischer Schnitte ist ein übliches Verfahren, um auf zellularer Ebene Gewebe und Gewebeänderungen zu untersuchen. Manchmal wäre es allerdings von Vorteil, wenn die zugrundeliegende drei-dimensionale (3-D) Struktur ebenfalls betrachtet werden könnte, um beispielsweise morphologische Merkmale besser zu erkennen.

Das Ziel dieses Projekts ist die 3-D Rekonstruktion von histologischen Datensätzen, wobei die Untersuchung und Implementierung folgender Schritte notwendig ist:

  • Auswahl der zur Rekonstruktion geeigneten Schnitte

  • Wiederherstellung der korrekten Reihenfolge der

Schnitte

  • Reduzierung von Artefakten

  • Starre und nicht-starre Registrierung der Schnitte

  • Segmentierung relevanter Strukturen

  • Speicherung und Darstellung des 3-D Volumens

Das Projekt beschäftigt sich vorwiegend mit der Rekonstruktion des Sehnervenkopfs. Dieser ist bei einigen Augenerkrankungen wie Glaukom von besonderem Interesse. Strukturelle Änderungen in dieser Region sollen durch Rekonstruktion leichter und besser erfasst und erforscht werden.

Des Weiteren werden die Möglichkeiten einer Kombination von rekonstruierten histologischen Datensätzen mit Volumina anderer bildgebender Modalitäten, z.B. OCT, untersucht.

Projektleitung:
Prof. Dr.-Ing. Joachim Hornegger, Prof. Dr. med. Elke Lütjen-Drecoll, Prof. Dr. med. Dr. h.c. Friedrich Paulsen

Beteiligte:
Simone Gaffling, M. Sc.

Stichwörter:
Mikroskopie; 3-D Rekonstruktion; Histologie; Morphologie

Laufzeit: 1.7.2008 - 28.2.2014

Förderer:
SAOT School of Advanced Optical Technologies

Kontakt:
Gaffling, Simone
Telefon +49 9131 85 27874, Fax +49 9131 85 27270, E-Mail: simone.gaffling@cs.fau.de
Publikationen
Gaffling, Simone ; Jäger, Florian ; Daum, Volker ; Tauchi, Miyuki ; Lütjen-Drecoll, Elke: Interpolation of Histological Slices by Means of Non-rigid Registration. In: Meinzer, Hans-Peter ; Deserno, Thomas Martin ; Handels, Heinz ; Tolxdorff, Thomas (Hrsg.) : Bildverarbeitung für die Medizin 2009 (Bildverarbeitung für die Medizin 2009 Heidelberg 22.03.09 - 25.03.09). Berlin : Springer, 2009, S. 267-271. - ISBN 978-3-540-93859-0
Gaffling, Simone: A Framework for fast 3-D Histomorphometric Reconstructions.Vortrag: The Association for Research in Vision and Ophthalmology, Inc. (ARVO) (Annual Meeting), The Association for Research in Vision and Ophthalmology, Inc. (ARVO), Fort Lauderdale, USA, 05.05..2010
Gaffling, Simone ; Daum, Volker ; Hornegger, Joachim: Landmark-constrained 3-D Histological Imaging: A Morphology-preserving Approach. In: Eisert, Peter ; Hornegger, Joachim ; Polthier, Konrad (Hrsg.) : VMV 2011: Vision, Modeling & Visualization (16th International Workshop on Vision, Modeling and Visualization 2011 Berlin 04-06.10.2011). Goslar, Germany : Eurographics Association, 2011, S. 309-316. - ISBN 978-3-905673-85-2
[doi>10.2312/PE/VMV/VMV11/309-316]
Henker, Robert ; Scholz, Michael ; Gaffling, Simone ; Asano, Nagayoshi ; Hampel, Ulrike ; Garreis, Fabian ; Hornegger, Joachim ; Paulsen, Friedrich: Morphological Features of the Porcine Lacrimal Gland and Its Compatibility for Human Lacrimal Gland Xenografting. In: PLoS one 8 (2013), Nr. 9, S. e74046
[doi>10.1371/journal.pone.0074046]
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