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Molecular Modelling (MSV-6L)5 ECTS (englische Bezeichnung: Molecular modelling)
Modulverantwortliche/r: Dirk Zahn Lehrende:
Dirk Zahn, Assistenten, Nico van Eikema Hommes
Startsemester: |
WS 2015/2016 | Dauer: |
2 Semester | Turnus: |
jährlich (WS) |
Präsenzzeit: |
90 Std. | Eigenstudium: |
60 Std. | Sprache: |
Deutsch |
Lehrveranstaltungen:
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Molecular Modelling (V/UE) (WS 2015/2016)
(Vorlesung mit Übung, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.206; Mo, 12:00 - 18:00, CCC 2.203; Do, 10:30 - 17:00, CCC 2.206, CCC 2.203; vom 23.11.2015 bis zum 11.12.2015)
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Molecular Modeling PRA (SS 2016)
(Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.203, CCC 2.206; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.203; vom 23.5.2016 bis zum 3.6.2016; Anmeldung über StudON)
Inhalt:
MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modeling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden
können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen
sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen
sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.
Literatur:
Ein umfassendes Skript für die Vor- und Nachbereitung des Stoffes werden online zur Verfügung gestellt (StudOn).
Bemerkung:
Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung Lifescience)
Organisatorisches:
Einpassung in Musterstudienplan: Im 5. und 6. Fachsemester
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan: Das Modul ist im Kontext der folgenden Studienfächer/Vertiefungsrichtungen verwendbar:
- Molecular Science (Bachelor of Science)
(Po-Vers. 2013 | Vertiefungsrichtung Nano Science / Life Science | Vertiefungsrichtung Life Science | Molecular Modelling)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Molecular Modelling (Prüfungsnummer: 30611)
(englischer Titel: Molecular Modelling)
- Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- weitere Erläuterungen:
Studien- und Prüfungsleistungen:
Portfolioprüfung (PFP): Molecular Modelling: W90 (PL)
Seminar Molecular Modelling: EX (PL)
Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL, AP)
Berechnung der Modulnote: W90 (PL) 50%, EX (PL) 25%, LAB (PL, AP) 25%
- Prüfungssprache: Deutsch
- Erstablegung: SS 2016
- Termin: 12.02.2016, 11:00 Uhr
Termin: 13.07.2016, 16:00 Uhr
Termin: 17.02.2017, 11:00 Uhr
Termin: 26.07.2017, 16:00 Uhr
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