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Mathematische Verfahren der Bioinformatik (ILS-M6)5 ECTS (englische Bezeichnung: Mathematical methods in bioinformatics)
(Prüfungsordnungsmodul: Mathematische Verfahren der Bioinformatik)
Modulverantwortliche/r: Alexander Martin Lehrende:
Fabian Wein
Startsemester: |
SS 2022 | Dauer: |
1 Semester | Turnus: |
jährlich (SS) |
Präsenzzeit: |
56 Std. | Eigenstudium: |
94 Std. | Sprache: |
Deutsch |
Lehrveranstaltungen:
Empfohlene Voraussetzungen:
keine
Inhalt:
- Monte Carlo Simulationen
Markov Modelle (MCMC Uniform Sampling Algorithmus, Zielverteilungs‐ Sampler/Metropolis Algorithmen, Simulated Annealing)
Hidden Markov Modelle (Bewertungsproblem, Erkennungsproblem, Trainingsproblem, Semi‐Markov Modelle)
Machine Learning (Neuronale Netze, Support Vector Machines, Klassifikation)
Faktoranalyse, Principal Component Analysis, Independent Component Analysis, zugehörige Algorithmen
Micro Arrays (Normalisierung)
UE
Aneignung der wesentlichen Begriffe und Techniken aus der Vorlesung erfolgt
durch praktische Übungen am Rechner (MATLAB) sowie Vorstellung und Diskussion
wöchentlicher Hausaufgaben in der Gruppe.
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
sind in der Lage, diskrete Optimierungsalgorithmen der Bioinformatik und ihre Implementation umfassen zu erklären und diskutieren;
sind fähig, die algorithmischen Ergebnisse im Kontext großer Datenmengen und stochastischer Modellvorstellungen angemessen zu interpretieren;
können die Vorlesungsinhalte in computergestützten Übungen praktisch, zielorientiert umsetzen;
sind zum problemorientierten analytischen Denken befähigt;
erweitern aufgrund der Kommunikationsfähigkeit ihre Selbstkompetenzen.
Literatur:
Bemerkung:
B.Sc. Integrated Life Sciences, B.Sc. Mathematik
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
- Integrated Life Sciences: Biologie, Biomathematik, Biophysik (Bachelor of Science)
(Po-Vers. 2019w | NatFak | Integrated Life Sciences: Biologie, Biomathematik, Biophysik (Bachelor of Science) | Pflichtmodule | Mathematische Verfahren der Bioinformatik)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Mathematische Verfahren der Bioinformatik (Prüfungsnummer: 58011)
(englischer Titel: Mathematical Methods in Bioinformatics)
- Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet, 5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- Erstablegung: SS 2022, 1. Wdh.: WS 2022/2023
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