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Molecular Modelling (MSV-6L)5 ECTS (englische Bezeichnung: Molecular modelling)
(Prüfungsordnungsmodul: Molecular Modelling)
Modulverantwortliche/r: Dirk Zahn Lehrende:
Dirk Zahn, Nico van Eikema Hommes
Startsemester: |
WS 2018/2019 | Dauer: |
2 Semester | Turnus: |
jährlich (WS) |
Präsenzzeit: |
90 Std. | Eigenstudium: |
60 Std. | Sprache: |
Deutsch |
Lehrveranstaltungen:
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Molecular Modelling (V/UE) (WS 2018/2019)
(Vorlesung mit Übung, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.206; Mo, 12:00 - 18:00, CCC 2.203, CCC 2.202a; Do, 10:30 - 17:00, CCC 2.206, CCC 2.203, CCC 2.202a; vom 26.11.2018 bis zum 14.12.2018)
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Molecular Modeling PRA (SS 2019)
(Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Anmeldung über StudON; für die genaue Zeiten, siehe Stundenplan)
Empfohlene Voraussetzungen:
Es wird empfohlen, folgende Module zu absolvieren, bevor dieses Modul belegt wird:
Biochemie und Molekularbiologie I und II (WS 2017/2018)
Inhalt:
MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modelling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden
können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen
sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen
sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.
Bemerkung:
Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung Lifescience)
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
- Molecular Science (Bachelor of Science)
(Po-Vers. 2013 | NatFak | Molecular Science (Bachelor of Science) | Vertiefungsrichtung Nano Science / Life Science | Vertiefungsrichtung Life Science | Molecular Modelling)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Molecular Modelling (Prüfungsnummer: 30611)
(englischer Titel: Molecular Modelling)
- Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- weitere Erläuterungen:
PFP:
Molecular Modelling: W90 (PL)
Seminar Molecular Modelling: EX (PL)
Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL, AP)
Berechnung der Modulnote: W90 (PL) 50%, EX (PL) 25%, LAB (PL, AP) 25%
Achtung:
Erstablegung der Klausur erfolgt im Wintersemester, die 1.Wiederholungsmöglichkeit dann im Sommersemester;
Notenverbuchung von Klausurnote und Praktikumsleistungen erfolgt erst im Sommersemester!
- Prüfungssprache: Deutsch
- Erstablegung: WS 2018/2019, 1. Wdh.: SS 2019
- Termin: 15.02.2019, 08:30 Uhr
Termin: 14.02.2020, 08:30 Uhr, Ort: H1
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