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Computational Biology (ILS-W1)15 ECTS (englische Bezeichnung: Computational Biology)
Modulverantwortliche/r: Rainer Böckmann Lehrende:
Rainer Böckmann, Vasily Zaburdaev
Start semester: |
WS 2019/2020 | Duration: |
1 semester | Cycle: |
jährlich (WS) |
Präsenzzeit: |
195 Std. | Eigenstudium: |
255 Std. | Language: |
Deutsch |
Lectures:
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ILS-W1: Computational Biology (Übung, PO 2009 u. Nebenfach Biologie)
(Übung, Rainer Böckmann, Thu, 12:00 - 14:00, 00.581; starting 24.10.2019)
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Literaturseminar Computational Biology
(Seminar, 1 SWS, Rainer Böckmann, Thu, 14:00 - 15:00, Raum n.V.; Raum Nr. 03.663-1 im Biologikum)
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ILS-W1: Computational Biology, Vorlesung (Teil 1)
(Vorlesung, Rainer Böckmann)
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ILS-W1: Computational Biology II (Lecture)
(Vorlesung, Vasily Zaburdaev, Wed, 8:00 - 10:00, HC)
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ILS-W1: Computational Biology II (Tutorial)
(Übung, Vasily Zaburdaev)
Inhalt:
Einführung in moderne Programmier-Sprachen und Simulations-Umgebungen:
Programmierung in MATLAB (einschliesslich der Einbindung einfacher C++ Programme)
Einführung in Diskretisierungs- und Lösungsverfahren für partielle Differentialgleichungen zur Beschreibung dynamischer Systeme
Datenbankformate und Skript-Sprachen (PYTHON, PERL) in der Bioinformatik.
Simulation dynamischer Systeme am Beispiel aktueller biologischer Fragestellungen, z.B:
Metabolische Flüsse
Signaltransduktion und Transkriptions-regulatorische Netzwerke
Zeitlich periodische Systeme
Biologische Musterbildung
Moleküldynamik
Zellbewegung und morphogenetische Bewegungen
Populationsgenetik und Evolutionsmodelle.
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
verfügen über vertiefte Kenntnisse wichtiger Programmier- und Simulationsumgebungen
sind fähig aktuelle Simulationsmodelle in Computational Biology am Computer selbständig anzuwenden
sind mit aktuellen Publikationen aus dem Bereich Computational Biology vertraut
können die Inhalte aktueller Publikationen aus dem Lerngebiet diskutieren und hinterfragen
verfügen über Kommunikationskompetenz.
Literatur:
Informationsmaterialien zur Vor- und Nachbereitung des Stoffes
werden im Internet und als Kopien zur Verfügung gestellt.
Studien-/Prüfungsleistungen:
Klausur Computational Biology (Teil 1) (Prüfungsnummer: 32702)
- Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %
- Erstablegung: WS 2019/2020, 1. Wdh.: SS 2020
1. Prüfer: | Rainer Böckmann |
- Termin: 13.02.2020, 10:00 Uhr, Ort: SR Biologie (U1.850)
Klausur Computational Biology II (Prüfungsnummer: 32703)
- Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %
- Erstablegung: WS 2019/2020, 1. Wdh.: SS 2020
1. Prüfer: | Vasily Zaburdaev |
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